ADNe ou ADN environnemental

L’ADN environnemental est de l’ADN d’origine animale, végétale, issue de champignons, bactéries ou virus perdu dans l’environnement donc par des êtres vivants ou des Virus. Il est produit par exemple par les excréments, l’urine, les cellules perdues, le sang ou les cadavres. On peut ainsi récolter de l’ADN soit ancien (sédiments relativement récents, pergélisols, glace…) ou actuel (eau, sols, substrats…), l’extraire et l’amplifier. A chaque étape s’opposent des difficultés liées notamment à la dégradation des molécules par des enzymes ou les températures élevées, des contaminations possibles. L’ADN disponible est alors séquencé par des méthode modernes, rapides et peu coûteuses et analysé selon des banques de données de référence.

Cette méthode permet de :

• déterminer les espèces présentes dans l’environnement,
• analyser des régimes alimentaires,
• faire une estimation de la Biodiversité,
• estimer l’abondance de certaines espèces.
• …

On a réussi à extraire et identifier de l’ADN dans des sédiments vieux de 200000 ans. Dans ce cas l’ADN est très altéré, mais fourni toutefois une grande quantité d’informations. Le principal défaut de la méthode est le risque de contamination de l’ADN par des apports non souhaités.