Données odonatologiques rhônalpines

Odonates > France > Rhône-Alpes

Je rapporte ici quelques lignes sur l’organisation des données odonatologiques en Rhône-Alpes depuis l’édition de l’Atlas régional (Deliry 2008) au montage de la base O’donata. On y découvre quelques concepts clés qui ont été développés ou sont en cours de développement : conventions de mutualisation des données à la suite de l’Atlas de 2008, base O’donata préparée dès 2018 et mise en fonction département par département entre septembre 2019 et mars 2020, importance de la visibilité des données pour la connaissance et la conservation, des données protocolées, respect de la paternité des données et projet de licences associées, principes de validation nuancée des données envisagés dès 2021, montages multi-sources de la base O’donata. L’historique antérieur pourra être rajouté…

Conventions de mutualisation des données (2008)

L’Atlas régional édité en 2008 est un des premiers cas de convention de valorisation des données odonatologique, signée avec le Muséum et la Ville de Grenoble. Une close souligne l’engagement du Muséum à mener une démarche conservation de conservation séculaire des données pour les générations futures. Il s’agit d’une acte muséologique sur des données naturalistes. Si le concept est remarquable pour l’époque, il n’a jamais été mis en œuvres en raison de dynamiques nouvelles de gestion en ligne de fichiers comme ceux du Pôle Invertébrés (Biodiv’AuRA), l’INPN en le SINP, le partage de données à destination de Faune AuRA, etc. toutefois la conservation séculaire se traduit par une dispersion des informations et des complications de bases ayant reçu les mêmes mentions, y compris pas sous la même qualité et avec dans divers cas une anonymisation des experts naturalistes, ce qui rend fragile leur qualité scientifique. Le tableau suivant rend compte des conventions établies par ordre chronologique.

AnnéeStructureGéographie et modalitésDernières mise à jour
2007RN des RamièresCo-gestion de la base départementale jusque récemmentPermanent par co-gestion, arrêté depuis quelques années suite au du départ à la retraite de Jean-Michel Faton, ancien conservateur… pas de suites pour l’instant
[2008]Muséum de GrenobleConservation séculaire de la base de donnée régional / Atlas 2008
Export : toutes les données régionales
Non car modification profonde du paysage informatique depuis
2010PN de la VanoiseImport / export : VanoiseI/E en 2011 et probablement imports plus récents
2012Observatoire savoyardImport à définir / export : toutes les données de SavoieImports partiels [?]
Export fin 2015
2013CEN IsèreImport : toute le département de l’Isère
Export : Sites du CEN
I/E fin 2014, quelques compléments partiels depuis
2013Faune AinImport / export : données de l’AinImport fin 2017, export répercuté au niveau régional puis suite régionale
2013Faune IsèreImport / export : données de l’IsèreImport fin 2017, export fin 2014, puis répercuté au niveau régional puis suite régionale
2013FRAPNA AinImport /export : toutes les données de l’AinI/E fin 2014
2013Faune SavoieImport /export : toutes les données de SavoieImport fin 2017, export répercuté au niveau régional puis suite régionale
2014Faune ArdècheImport / export : données de l’ArdècheImport fin 2017, export répercuté au niveau régional puis suite régionale
2014Faune LoireImport / export : données de la LoireImport fin 2017, export fin 2015, puis répercuté au niveau régional puis suite régionale
2014Faune RhôneImport / export : données du RhôneImport fin 2017, export fin 2014 puis répercuté au niveau régional puis suite régionale
2014FRAPNA LoireImport / export : toutes les données de la Loirefin 2015 et import en 2021, mais pas d’export
2014PNR du PilatImport / export : massif du PilatI/E fin 2014
2015Drac AvalExport : Drac AvalRéalisé par la LPO Isère (détails non connus)
2015Faune DrômeImport / export : données de la DrômeImport fin 2017, export répercuté au niveau régional puis suite régionale
2015Faune Haute-SavoieImport / export : données de Haute-SavoiePas d’import spécifique avant, export répercuté au niveau régional puis suite régionale (nouvelle convention plus
large)
2015FRAPNA Haute-SavoieImport / export : toutes les données de Haute-Savoiepas d’import, export fin 2015
2015ONC Dombes 2015Import : Dombes, Bresse, Val de Saône
Export : Dombes
Non réalisé
2015
2017
TEREO (BE)
Renouvelée 2017
Import : région entière
Export : selon demande
Import pour partie 2021 sur des données de 2017
Export selon quelques demandes
2016Monts de la MadeleineImport : Monts de la MadeleineProbablement réalisé, à vérifier dans la base O’donata Loire
2016Atlas GenevoisImport / export : Pays GenevoisImports antérieurs à 2016, mal reconduits [?]
Export fin 2016
2016EcoMed (BE)Import : région entière
Export : selon demande
Non réalisé, quelques demandes
2016VercorsExport : VercorsRéalisé par la LPO Isère (détails non connus)
2017Asconit Consultant (BE)Import : région entière
Export : selon demande
Non réalisé, quelques demandes
2017Ecosphère (BE)Import : région entière
Export : selon demande
Non réalisé, quelques demandes
2017Société française d’OdonatologieImport : région entière
Export : France (dont base Entre Amis)
Très partiellement réalisé en raison de la dissolution précoce de la SfO, le groupe Opie Odonates ne gérant pas explicitement de BDD depuis a hérité des bases INVOD et du CILIF
2018Epode (BE)Import : région entière
Export : selon demande
Non réalisé, quelques demandes
2018ONC Dombes 2018Import Leucorrhinia pectoralis
Export : non prévu (cf. 2015)
Si l’import a pu être fait, il n’a pas été rapporté dans la base O’donata depuis

Données RhoMeo (2014)

Une convention préparée avec le CEN rhônalpin en 2014 devait nous permettre d’accéder aux données récoltés dans le cadre de divers programmes RhoMeo des partenaires du Conservatoire, en échange de données sur le département du Rhône. Cette convention et ces échanges qui n’ont pas aboutis en raison de la complexité de la diversité des contacts associé à un suivi difficile du projet révèlent qu’au moins une part importantes de données protocolées sont disponibles au CEN rhônalpin.

Relations avec le Pôle Invertébrés

Nécessité d’extension de la base régionale à la grande région Auvergne Rhône-Alpes

Une proposition d’extension de la base O’donata en incluant l’Auvergne est proposée au Groupe Odonat’Auvergne. Cette démarche s’avère nécessaire pour la gestion de projets à dimension AuRA comme la préparation d’une Liste Rouge régionale. Cette démarche est relayée en 2025 par la mise en forme de Biodiv’AuRA dans le cadre de la préparation de la Liste Rouge pour la grande région, à venir. À suivre…

Montage de la plateforme partagée O’donata (2018-2020)

Dominique Mouchené a préparé et maintien le fonctionnement en ligne de la base O’donata grâce à ses importantes compétences de programmation en php et d’utilisation de structures relationnelles mysql. Lors de sa mise en place j’étais gestionnaire de la base sous FileMaker et réunissais régulièrement les fichiers départementaux, locaux ou particuliers dans une base régionale complète. Près d’une année (celle de 2018) de mise en forme de données éparses ou non a été utile pour monter le projet. Il a fallu pour ce faire rassembler de nombreux fichiers excel et les ajouter aux données du département de l’Ain (version à jour au 6 janvier 2018), rassembler deux tables principales pour l’Ardèche (version du 28 décembre 2018), ainsi que des fichiers plus simples car déjà compilés par Jean-Michel Faton pour la Drôme (Entre Amis et Sympétrum) (version du 25 décembre 2018), par moi-même pour l’Isère (version de décembre 2017) et ajouter des fichiers forgés par Dominique Mouchené (1er mars 2019), Jörg Schleicher (années 2017-2018 en trois fichiers), ainsi que les données Faune par départements (état mars 2019). Ainsi le 1er mars 2019, Dominique Mouchené rassemble en un seul fichier toutes les mentions disponibles et les rend compatibles avec la plateforme O’donata. Le tableau suivant rend compte de la chronologie progressive des données à la plateforme O’donata.

État des lieux et fondation des fichiers compilés : avant O’donata
AinLa base de donnée Ain est gérée directement dans la base régionale coordonnée par Cyrille Deliry sous Paradox puis FileMaker. Le fichier livré est le résultat amélioré par l’ajout de plusieurs dizaines de rapports ponctuels sous Excel ou Word correspondant à des fiches sites par sites, fournis principalement par Régis Krieg-Jacquier. Des élément supplémentaires ont été transmis par la FRAPNA Ain. Le tout a été fusionnés dans un format commun, ce qui a été un gros ouvrage pour la préparation à l’exportation à destination de la base O’donata. De nombreuses données supplémentaires ont été saisies directement sur Faune Ain et seront intégrées en janvier 2020. Les sous-espèces sont souvent implicites et mériteraient d’être fondées sur des déterminations réelles. Les bases locales comme celles du CEN antenne Ain, ou de FNE Ain, voire d’autres bases comme Isara sur la Dombes sont des lacunes à résoudre.
ArdècheLa base ardéchoise a été menée en parallèle, pour partie synchronisée par Alain Ladet, en collaboration avec la FRAPNA Ardèche et Pierre Juliand. Une forte duplication a été introduite au niveau régional lors de la réalisation du fichier pour l’Atlas de 2008, en particulière par réplication des localités complexes à gérer sur ce département. Le fichier fusionné pour O’donata comportait encore une part de doublons significative, héritage d’une histoire complexe de gestion de la base.
DrômeLa base pour la Drôme a été initiée par Jean-Michel Faton, sous FileMaker, en collaboration avec la base Entre Amis, synchronisée avec la base régionale en ce qui concerne les Odonates régulièrement. Son montage a été relativement simplifié pour O’donata. Les sous-espèces sont souvent implicites et mériteraient d’être fondées sur des déterminations réelles.
IsèreLa toute première base du GRPLS a été fondée en Isère par David Loose, à l’origine sur du matériel informatique « préhistorique ». Elle a basculé sous Paradox, puis gérée en commun avec la base régionale par Cyrille Deliry, passant ensuite sous FileMaker et dynamisée en collaboration avec la base Entre Amis. Des fichiers divers supplémentaires avaient déjà été intégrés depuis du matériel informatique local comme celui de l’île de La Platière, de Lo Parvi ou d’Avenir par exemple ainsi que ceux de naturalistes autonomes. La fusion était quasi réalisée avec son intégration dans la base O’donata. Une synchronisation des données avec les Réserves Naturelles, Lo Parvi, Nature Vivante ou le CEN Isère (Avenir) semble un bon objectif et les manques vont en s’amplifiant depuis une poignée d’années.
LoireQuelques éléments de la base départementale avaient été récoltés dans la base régionale souvent selon des sources issues de naturalistes autonomes. Un gros travail de mise au propre complété par des relevés de terrain nombreux a été mené par Yoann Boeglin avec l’aide de Julien Sthème de Jubécourt qui ont aussi fortement travailler à rassembler les données éparses auprès de structures particulières. Il n’y a pas eu de travail majeur à faire pour l’intégrer dans la base O’donata, puisqu’un Atlas départemental était en préparation. Celui-ci sera finalisé en 2022, grâce à la dynamique du Bureau du Groupe Sympetrum sous la coordination de Cyrille Deliry et en collaboration avec FNE Loire qui vient ajouter tardivement ses données propres. Ces événements sont postérieurs à l’intégration des données dans la base O’donata en novembre 2019 et l’Atlas réalisé a bénéficié de solides bases méthodologiques. Une synchronisation des données avec FNE Loire na pas été faite depuis la parution de l’Atlas de 2022. Par ailleurs des données supplémentaires manquent et sont connues pour les PNR du département (Madeleine, Forez, Pilat). Les données Isara obtenues pour les étangs du Forez n’ont pas été remises au GRPLS par la coordination sortante au moment de la publication de l’Atlas et bien antérieurement des données nombreuses de Dominique Brugière, négociés par Stéphane Pissavin pour leur intégration à l’Atlas régional de 2008, ne sont jamais parvenues.
RhôneLa base du département du Rhône a été montée au niveau de la coordination régionale par Cyrille Deliry. Elle a bénéficié de l’intervention du Muséum de Grenoble qui a permis de libérer le fichier de Daniel Grand disponible au Musée Guimet de Lyon. Des ajouts ultérieurs significatifs proviennent de FNE Rhône, sous la dynamique de Julien Bouniol. La base a été relayée en outre par les coordonnateurs successifs : Gwénaël David et Benjamin Le Mell. Elle est restée synchronisée avec la base régionale de manière régulière où ont été intégrés les données de FNE Rhône. La base O’donata a bénéficié d’une fichier relativement propre au moment de l’intégration faite en novembre 2019.
SavoieLa base savoyarde a été initiée par Cyrille Deliry sous Paradox, selon les directives compétentes de David Loose qui menait un travail similaire en Isère. Elle passe sous FileMaker et est confiée à Dominique Mouchené qui prend le relais et renforce son contenu auprès du Parc de la Vanoise ou de l’Observatoire départemental coordonné par le CPNS par exemple. Des fichiers autonomes supplémentaires ont été intégrés. L’intégration à O’donata, complétés de fichiers spécifiques de Dominique Mouchené a pu être au cœur des premiers tests de construction de la plateforme en ligne O’donata.
Haute-SavoieLa base pour la Haute-Savoie a été dans un premier temps menée en parallèle entre un fichier Paradox préparé par Cyrille Deliry, qui avec ceux de l’Isère et de la Savoie ont constitué un fond signification pour l’édition de l’Atlas de 1997 et une base Access piloté par Bernard Bal chez Asters, en collaboration avec le GRPLS. Le montage de la base fusionnée a été fait directement par Dominique Mouchené dans le cadre de la préparation de l’intégration à la base O’donata puisque ce sont des fichiers d’Asters fourni par Bernard Bal, de FNE Haute-Savoie fourni par Marie Lamouille-Hébert, d’anciens fichiers ré-assemblés fournis à partir des archives du GRPLS qui ont permis la constitution d’un fichier fusionné.
Hautes-AlpesLe fichier Hautes-Alpes a été initié par Cyrille Deliry en collaboration avec Alain Marie et le Parc National des Ecrins. Il comporte finalement peu de mentions au moment de la fusion des différents fichiers utilisés in extremis sur un espace spécial Hautes-Alpes en mars 2020 sur O’donata. Les prospections départementales sont a priori faibles. Des lacunes concernent probablement des données du Parc des Ecrins, non recueillies depuis plus de 10 ans, ainsi que de manière signification des données du CEEP, de SILENE et de Faune Paca. Celles de Faune Paca ont été rassemblées ultérieurement dans le cadre d’une convention « tardive » de mutualisation des données avec la LPO Paca. Si le portail O’donata subsiste, l’absence de coordination récente sur les Hautes-Alpes et un intérêt déjà diminué du Groupe Sympetrum pour ce département font que depuis 2024, la gestion de la base départementale est organisée dans le cadre de la dynamique dauphinoise Entre Amis pas Cyrille Deliry, voulue en collaboration avec la coordination régionale de la base O’donata.
Extra-régionalLe Groupe Sympetrum a rassemblé de nombreuses données extra-régionale qui n’étant intégrés au fichiers O’donata, qui est plateforme construite avec un fichier par département, sont déléguées à la dynamique Entre Amis. Les Hautes-Alpes intègrent cette option en 2024, tout en conservation une interface collaborative sur la plateforme O’donata, héritage du travail de l’Atlas de 2008 qui intégrait exceptionnellement ce département. C’est déjà dans le cadre de la dynamique Entre Amis que le fichier de la Société française d’Odonatologie a pu se construire, d’abord en ligne sous la coordination de Cyrille Deliry et qu’il a pu être ensuite intégré à la fois à Faune Paca et à l’Atlas régional publié sous la coordination de Michel Papazian en 2017. La dynamique Entre Amis se resserre sur les départements du Dauphiné, l’Isère, la Drôme et les Hautes-Alpes, tout en conservant une ouverture à la gestions de données obtenues de manière opportunistes au grès de relations particulières avec divers naturalistes.
Tableau de l’état des lieux et du montage des fichiers sources pour O’donata à partir d’un suivi complexifié depuis l’Atlas édité en 2008
2019-2020IsèreAinRhôneDrômeH.SavoieLoireSavoieFauneArdècheH.Alpes
Intégration O’donata11.0919.0908.1111.1111.1121.1115.1209.0114.0124.03
Mentions5156935205302614562325186421281288445619387302334
Nombre cumulé5156983774114035159658184844226972239856285475324205326539
ajout.Faune (> 17.10.2017)
Cumul départemental
7963
59532
13429
48634
3513
33774
5733
51356
1920
27106
3208
45336
3915
16799
NA5938
44668
0
2334
Tableau d’intégration des fichiers sources entre septembre 2019 et mars 2020 pour complétion de la base O’donata, travail finalisé par Dominique Mouchené en collaboration avec Cyrille Deliry

Visibilité des données odonatologiques (2020)

Ayant identifié le fait qu’un nombre important de données n’étaient pas rendues publiques sur Faune France, Cyrille Deliry rédige un argumentaire sur les conséquences sur le déficit de prospections et les problèmes de suivi avec des conséquences sur les espèces. De la liste, une seule espèce, Nehalennia speciosa avait des arguments suffisants pour que ses mentions restent privées. Nous posons la question au CoPil Faune France le 14 septembre 2020 et relancée par courrier le 24 septembre 2021. Le Groupe Sympetrum est missionné pour monter une équipe de réflexion nationale sur le sujet. Jean-Michel Faton coordonne l’animation de cette équipe qui après plusieurs réunions conclue au masquage au cas par cas des données en fonction de leur sensibilité locale (menaces, propriétés privées) et seule Nehalennia speciosa est maintenue dans la liste privée. Il est à noter que cette espèce a disparu de sa localité (secrète) française située dans le Jura et la question qui se pose est : n’aurait-elle pas pu profiter d’une meilleure veille collective si la localité avait été suivie de manière raisonnée par la communauté naturaliste et alors pu éventuellement être sauvée ?

Réunions de la coordination régionale (…2020)

  • 20 novembre 2020 – A suivre…
  • 5 janvier 2022 (Jean-Michel Faton, Cyrille Deliry, Dominique Mouchené), compte-rendu rédigé : thème principal : moissonnage des données odonatologiques, ce qui revient au principe de gestion d’une base O’donata multi-source. La mise en place d’une formation à l’utilisation optimisée de la plate-forme en ligne O’donata sera proposée ej parallèle de l’assemblée générale de mars 2022.

Données protocolées (2020)

Jean-Michel Faton signale le 5 octobre 2020 à M.Jeanmougin qui avait annoncé la mise en place d’un projet international de suivi de l’abondance des Odonates, que nous disposons de près de 10000 données protocolées dans la base O’donata. En réponse leur fourniture serait prématurée et qu’il reviendrait vers le Groupe Sympetrum au moment adéquate. L’intérêt des suivis protocolés a été intégré de longue date à la base régionale. Le 31 mars 2022 Jean-Michel Faton a extrait de ses archives et de la base O’donata un tableau qui rassemble les principales données de ce type. Nous n’avons pas eu de suite du projet international, néanmoins il semble pour partie devenu le projet Dragon annoncé en 2025 et pour partie associé à la nouvelle structure sur les Odonates d’Europe fondée cette même année.

Phénologie : dates précoces ou tardives (…2021)

Jean-Michel Faton avait mis en route de longue date un tableau excel partagé afin que chacun puisse le renseigner avec ses propres observations. Cette démarche avait été valorisée sur les réseaux sociaux et les forums de discussion odonatologiques. Le tableau a été dans un premier temps bien complété. En novembre et décembre 2021, il convient de finaliser ce travail sur Faune France de manière à améliorer les résultats. Les coordonnateurs départementaux ont été sollicités pour ce projet et Dominique Mouchené a développé un module de lecture propre pour la base O’donata. Le projet qui devait être finalisé dans l’hiver n’a pas abouti. Il est à reprendre…

Respect de la Paternité des données (…2021)

La problématique de l’anonymisation des données exportées depuis Faune France pour l’INPN par exemple ou d’autres plateformes collaboratives pose le problème de l’équilibre entre le RGPD et la qualité scientifique des données qui n’ont de valeur réelle que si elles sont associées à une expert qui en a la paternité. Jean-Michel Faton et Cyrille Deliry organisent des contacts avec l’INPN mi-avril 2021 afin de pouvoir revaloriser les données régionales pour la base nationale du Muséum. Une dynamique Atlas national multi-sources est alors envisagée. Pas de suites pour l’instant.

Le CoPil Faune France valide le 25 novembre 2021 le principe de formulaire de consentement à transmission des données pour les associations et les observateur. La mise en œuvre d’un tel formulaire est prévue avec Biolovision. Suite à la réunion de coordination O’donata du 5 janvier 2022, il est rappelé l’intérêt de mise en place de licences © ou creative commons adéquate à la manière du GBIF dans un champ particulier renseignant sur les droits d’usage et leurs limites mention par mention. J’ai dressé une première versions des options sur ce thème, application de licences à chacune de données qui est rassemblé dans le diagramme suivant.

Licences ©opyright et creative commons pour la bonne gestion et exportation des données (réal. C.Deliry)

Listes départementales d’espèces (…2021)

Ain – Jean-Michel Faton entame le 1er septembre 2021, la révision des listes départementales de la région Rhône-Alpes en diffusant un premier tableau construit à partir de la base O’donata pour l’Ain. Celui-ci comprend 72 espèces desquelles Régis Krieg-Jacquier écarte Platycnemis latipes, Platycnemis acutipennis et Coenagrion ornatum car elles sont soit non étayées, soit vraisemblablement erronées. Cyrille Deliry discute des éléments connus sur ces trois espèces en rapport avec le département et l’attention est portée sur l’invalidation des anciennes indications de Platycnemis latipes dans le département discutées sur le forum insecte.org , et invite à rédiger une publication sur le sujet.

Drôme – Jean-Michel Faton annonce le 1er septembre 2021 dans le cadre d’une révision des listes départementales de la région Rhône-Alpes le montage, après un tableau diffusé pour l’Ain, d’un tableau des espèces du département de la Drôme.

Tableau dans sa version du 22 janvier 2022, il n’a pas évolué ensuite

Validations des données (…2021)

La structuration améliorée des pages espèces de la base O’donata permet de mieux repérer les données déviantes et de travailler à leur meilleures validation ou non (Réunion de coordination du 5 janvier 2022).

Validations nuancée SINP – Cyrille Deliry propose à la coordination de la base O’donata, avec une première version, le 23 mai 2021, d’améliorer le système de validation des données odonatologiques qui est jusqu’alors binaire (valide / invalidé) sur les bases de la méthodologie nuancées du SINP. Ce sujet est remis sur l’ouvrage les 21 janvier 2022 et 7 janvier 2023. L’adoption de ce projet est alors envisagé en 2023 et une réunion de coordination est envisagée. En parallèle le CoPil de Faune France du 25 novembre 2021, précise que des principes nuancés de validation des données selon la même logique que la méthodologie du SINP, sont en préparation de manière synchronisée notamment l’équipe de naturalistes suisse. En ce qui concerne les validateurs départementaux actifs sur Faune France, un audit sur les différents départements rhônalpin est lancé en décembre 2022 afin de mieux cerner le pool des validateurs localité par localité.

Dédoublonnage et géolocalisation des données sur O’donata (…2022)

Méthodologie de géolocalisation de qualité (réal. C.Deliry

Suite à la réunion de coordination du 5 janvier 2022, la nécessité sur de faire un bilan sur le travail de dédoublonnage et de géolocalisation des données. Dans la mesure où le travail de géolocalisation est terminé en première phase Cyrille Deliry propose un protocole de résolutions afin d’améliorer encore cette démarche qui est donné dans le diagramme suivant. Cyrille Deliry a fourni le 25 février 2021, à partir des archives historiques de la base régionale du GRPLS un fichier comprenant de nombreuses mentions qui avaient géocoordonnées en Grade avec précision et qui méritent d’être confrontés avec les résultats actuels de la base O’donata.

Protocole pour une stratégie d’amélioration de la géolocation des anciennes données de la base O’donata

Dans ce contexte stratégique, j’ai réalisé à titre expérimental, début 2022, un contrôle en direct des données d’espèces menacés (ligne surlignée en jaune) pour les années 2020 et 2021, pour les départements de l’Ain et de l’Ardèche sous FileMaker qui permet de visualiser en direct le détail des données et leur aspect en ligne sur Faune France, ainsi que leur état de validation.

Dimension multi-sources de la base O’donata (…2022)

Le renfort de la dimension multi-sources de la base O’donata multi-source est discuté lors de la réunion de coordination du 5 janvier 2022. En effet les données odonatologiques disponibles se trouvent éclatées dans différentes base particulières dont les plus significatives sont Faune France, Observado, le Pôle Invertébrés, OpenObs et le GBIF. La nécessité d’identifier les données originales apparaît importante. Le principe de « salle d’attente » pour des données importées et à intégrer à la base O’donata est suggéré. Les données en attente pourront alors être basculées (ou non) après contrôle par le coordonnateurs locaux vers la base O’donata. Cyrille Deliry propose le 4 février 2023 le renfort et une structuration d’un protocole de moissonnage organisé et régulier de données à partir des différentes sources ouvertes disponibles qui pourraient comprendre des observations régionales.

Faune France – L’intégration par Dominique Mouchené des données régionales de Faune AuRA réalisée le 7 décembre 2022 ajoute 34284 observations à la base O’donata. La prochaine importation est prévue en décembre 2023. Suite à la la réunion de la coordination O’donata du 5 janvier 2022, les principes d’accès à la base Faune France étant établis, Cyrille Deliry (Gp.Sympetrum) prendra contact avec Philippe Jourde (Fa.France) afin de pouvoir intégrer les données 2021 et l’ouverture des droits d’import seront stabilisés. La mise en place d’un Comité de Pilotage AuRA sera demandé auprès de Faune AuRA. La synchronisation correcte des données nécessite des imports complets pour mise à jour des données qui peuvent « vivre » sur Faune France.

Observado (observations.org) – Jean-Michel Faton a obtenu au printemps 2021 les données nationales présentes sur la base observations.org. Il y a 3610 données rhônalpines de qualité différente. Elles seront seront mises en « salle d’attente » pour être intégrées ou non à la base O’donata par les coordinateurs locaux comme proposé lors de la réunion de coordination O’donata du 5 janvier 2022.

Odonata Central – Signalé comme source supplémentaire. A suivre…

Pôle Invertébrés – La base comprend des données originales, par exemple issues de Bureaux d’études ou de naturalistes indépendants qui doivent être intégrées à la base O’donata (Réunion de coordination du 5 janvier 2022). Une gestion annuelle est requise. Il est à noter que Pierre Juliand a travaillé à la validation des données du CEN régional, selon une commande faite au Groupe Sympetrum. Le positionnement de l’association pour la validation des données du Pôle Invertébrés est préconisée.

iNaturalist – Cette plateforme de données partagées en ligne est appelée à devenir leader mondial au sujet des données naturalistes comme Cyrille Deliry le précise lors de la réunion de coordination O’donata du 5 janvier 2022. De nombreuses mentions sont toutefois sous pseudonymes et une base relais de traduction de ces pseudonyme est proposée pour mieux identifier les naturalistes réels et ainsi valoriser leur rôle d’experts.

Faune Paca – Cyrille Deliry, coordonnateur Hautes-Alpes souligne lors de la réunion de coordination du 5 janvier 2022, la difficulté à intégrer les données de Faune Paca qui sont significativement nombreuses, à la base O’donata. Les contacts sont maintenus avec la LPO PACA afin qu’une solution fonctionnelle soit mise en place.

CardObs / OpenObs – Une première exportation montre qu’OpenObs libère 159907 données, selon une importation du 20 janvier 2021 faite par Jean-Michel Faton. Toutefois elles apparaissent peu exploitables selon Dominique Mouchené (> 30000 mentions anonymisées, > 5000 non datées, > 2500 d’odonates déterminées au niveau du genre seulement, > 1200 géolocalisables au département seulement, > 133000 données géolocalisables à la commune seulement, avec des erreurs flagrantes, > 5000 données géolocalisables selon un polygone de dimension inconnu, > 7000 données pointées, mais mal placées… un tri important est à réaliser). Une exportation régionale est faite de nouveau à partir du serveur national associé à l’INPN par Jean-Michel Faton en décembre 2022. De manière significative, il y a sur les 2042 mentions repérées fournies à raison de 965 données de Cyrille Deliry et 1077 par Cédric Jacquier, sur les 2404 observations vues depuis cette plateforme. Les données de Cédric Jacquier étaient pour l’essentiel déjà intégrées à O’donata et Cyrille Deliry doit examiner son lot de données supplémentaires.

Carte des mentions depuis OpenObs préparée par Jean-Michel Faton en 2021

Projet de portail public pour la base O’donata (2022)

Les 8 février et 13 septembre 2022, le CA du Groupe Sympetrum discute d’un projet de mise en place d’un portail public de consultation organisée et limitée de la base O’donata dans une logique de partage des informations.

Principe d’autonomie de la base O’donata : projet conservatoire (2024)

Vu les enjeux et l’importance de la base O’donata pour la conservation de la mémoire naturaliste régionale et en regard d’une certaine distance politique prise par le Groupe Sympetrum vis à vis de cet objet, j’envisage le 27 novembre 2024, auprès des coordonateurs régionaux que nous mettions en place une certaine indépendance de la Base de données, notamment à des fins de conservation séculaire pour les générations futures, telles qu’elle a déjà été mise en projet avec le Muséum de Grenoble dans le cadre de la rédaction de l’Atlas de 2008. Une réunion sur le sujet est programmée le 9 décembre 2024.

Après avoir démissionné de mon poste de coordonnateur régional le 13 mars 2023, maintenant en routine ma démarche de travail sur la base O’donata, je me retrouve en difficulté dans mon travail de fond suite à la suppression des comptes d’accès décidé par les administrateurs au printemps 2025. Je pose donc ma candidature de reprise de la coordination par courrier du 9 août 2025. Celle-ci a été rejetée le 10 septembre 2025 par le Conseil d’administration pour des motifs non publiés. Me voici contraint de tourner la page. – CD

Lacunes à résoudre et perspectives

Toutes mes données ne sont pas encore sur O’donata, car faute de gérer l’intégralité, j’ai négligé par exemple une partie de mes propres observations. On trouve encore des lacunes certaines ou probables par départements avec pour l’Ain, les données Isara Dombes suite aux travaux de l’équipe de Béat Oertli, ainsi que des travaux sur la Réserve Naturelle du Marais de Lavours, notamment d’Antoine Racine. L’Ardèche est concernée par une part significative de données obtenues collectivement dans le cadre des OdoRunAlpes sur l’Eyrieux qui n’ont pas été saisies, ainsi que des mentions du BEED local et peut-être quelques autres pour le Parc des Monts d’Ardèche ou celui des Cévennes. La Drôme avec probablement des données particulières au Tricastin de bureaux d’étude mérionaux est à enrichir. La base Isère présente des mentions probablement dans les bases des Réserves Naturelles et en particulier les données récentes de l’île de la Platière ou du Luitel, ainsi que pour le Drac Aval, des mentions du CEN Isère, de Lo Parvi ou Nature Vivante sur près d’une décennie, ainsi que les missions de terrain de Lionnel Loubignac que j’avais encadré sur les terrain pour le Bassin de la Varèze et qui sont encore dans mes archives. Ce sont autant de lacunes possibles ou certaines pour ce département. Pour la Loire les données de Dominique Brugière ne nous sont jamais parvenues, celles de l’Isara pour les étangs du Forez, non pas été livrées par la coordination départementale du Groupe Sympetrum lors de son départ et FNE Loire doit enrichir sa base qui n’a pas été synchronisée depuis 2022. Le Rhône pourrait en avoir quelques autres et c’est notamment le cas de quelques études des années 2000 qui n’ont jamais été transformées en données informatiques. Des mentions supplémentaires pour Savoie et la Haute-Savoie doivent se trouver au CEN (CPNS, Asters), voire chez des naturalistes du pays genevois, alors que celles du Haut-Giffre sont connues partiellement. Pour la Savoie il semble possible que des données d’André Miquet et de Philippe Vallet que j’avais préparée il y a deux-trois ans restent à intégrer à la base O’odonata. A une échelle régionale les relevés RhoMeo nombreux sur la région seraient dans une base du CEN régional, mais semblent perdues depuis. Un travail à l’échelle de la grande région dans la récupération des données a été lancée par FNE Haute-Savoie avec le Pôle Invertébré, sur la plateforme Biodiv’AuRA dans le cadre de la préparation d’une Liste Rouge préparée en collaboration d’une équipe spécifique à ce projet depuis le milieu de l’année 2025. Ceci témoigne de nouvelles politiques de mise en valeur des données régionales actuellement envisagées par l’équipe dirigeante du Groupe Sympetrum, avec perte possible des fonctions de la base O’donata. Enfin la contribution du terrain du programme CIMaE coordonné par Marie Lamouille-Hébert sera intégrée à la base O’donata, suite à la livraison à la coordination régionale des fichiers, cette année 2025.

CD – Niort le 28 décembre 2025